技能闪光不仅是一种视觉特效，更是探索黑暗区域的关键能力。这种技能在释放时会散发出耀眼光芒，帮助玩家在岩山隧道等昏暗场景中看清道路。获得闪光的方式包括完成特定任务或与NPC互动，例如在月见山入口处的研究员会要求玩家捕获10种宝可梦后赠送HM05闪光。掌握这一技能后，玩家可以更高效地探索隐藏区域，避免因视野受限而错过重要道具或路径。
除了闪光，技能原始力量也蕴含着独特的战斗潜力。这类技能通常与特定属性或宝可梦的进化条件相关，例如通过遗传或使用特殊道具触发。原始力量在战斗中不仅能造成伤害，还可能附带特殊效果，如改变天气或提升自身属性。玩家需要深入研究每只宝可梦的技能树，才能充分发挥原始力量的战术价值。部分技能的隐藏效果仅在高等级或特定条件下激活，因此持续培养宝可梦是解锁这些能力的关键。
祈愿PP机制则进一步体现了技能系统的深度。通过任务或道具提升技能的PP值，可以增加使用次数或强化威力。某些隐藏任务会奖励PP提升剂，而宝可梦中心的NPC也能帮助遗忘不必要的秘传技能，腾出空间学习更实用的招式。合理分配PP资源，优先强化核心技能，是优化队伍战斗力的重要策略。部分技能的PP值与宝可梦的亲密度挂钩，这要求玩家在冒险中注重与伙伴的互动。
一字斩可以清除挡路的树木，冲浪能够跨越水域，这些技能既是探索工具，也是战斗手段。玩家需要平衡技能的功能性与战斗适用性，例如让辅助型宝可梦学习闪光或冲浪，而主力战斗成员则保留攻击技能。这种多用途设计让技能系统成为连接游戏叙事与玩法的重要纽带，也为玩家提供了丰富的策略选择空间。
